Genetics and Genomics Servizio di progettazione di copertine di riviste (GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

Le analisi genomiche e trascrittomiche consentono l'identificazione di importanti geni associati alla deposizione di grasso sottocutaneo nelle vacche Holstein

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

Gli obiettivi principali di questo studio sono identificare i geni candidati chiave che regolano la deposizione di grasso sottocutaneo nelle vacche da latte ad alta produzione integrando set di dati genomici e trascrittomici. Un totale di 1654 vacche Holstein genotipizzate viene utilizzato per eseguire uno studio di associazione sull'intero genoma (GWAS) con l'obiettivo di identificare i geni associati alla deposizione di grasso sottocutaneo. Successivamente, vengono condotte analisi della rete di coespressione genica ponderata (WGCNA) sulla base dei dati di sequenziamento dell'RNA di 34 mucche e delle deviazioni nella resa delle vacche legate alla deposizione di grasso sottocutaneo. Infine, si ottengono mRNA differenzialmente espressi (DE), lncRNA e geni di splicing differenziale alternativo per 12 mucche Holstein con fenotipi estremi e divergenti per la deposizione di grasso sottocutaneo. Integrando tutti i risultati, i geni NID2, STARD3, UFC1, DEDD, PPP1R1B e USP21 sono considerati i geni candidati più importanti che influenzano i tratti di deposizione di grasso sottocutaneo nelle vacche Holstein.