Nucleic Acids Research Servizio di progettazione di copertine di riviste (NEMO-TOC)

 Nucleic Acids Research

11 July 2022

Un algoritmo di clustering di trasformazione e sua applicazione nella profilazione strutturale dei poliribosomi

Wenhong Jiang¹, Jonathan Wagner^2,3, Wenjing Du¹, Juergen Plitzko⁴, Wolfgang Baumeister², Florian Beck⁴ and Qiang Guo^1,5

10.1093/nar/gkac547

I miglioramenti nella preparazione dei campioni per la tomografia crioelettronica, nelle strumentazioni per la microscopia elettronica e negli algoritmi di elaborazione delle immagini hanno fatto avanzare l'analisi strutturale delle macromolecole in situ. Al di là di tali analisi delle singole macromolecole, lo studio delle loro interazioni con i vicini funzionalmente correlati in habitat cellulari affollati, vale a dire la “sociologia molecolare”, è di fondamentale importanza in biologia. Qui presentiamo un algoritmo NEighboring Molecule TOpology Clustering (NEMO-TOC). Abbiamo ottimizzato questo algoritmo per il rilevamento e la profilazione dei poliribosomi, che svolgono ruoli sia costitutivi che regolatori nell'espressione genica. I nostri risultati suggeriscono un modello in cui i polisomi si formano collegando più blocchi non stocastici, in cui la traduzione è probabilmente sincronizzata.