Volume 188, numero 9p2521-2539.e22 1 maggio 2025
Rui Dai1,2,3,4,11 ∙ Jingying Zhang2,3,11 ∙ Fang Liu1,11 ∙ Haoran Xu1,3,4 ∙ Jing-Mei Qian1,3,4 ∙ Shani Cheskis5 ∙ Weidong Liu1,3,4 ∙ Binglei Wang2 ∙ Honghui Zhu6 ∙ Lotte JU Pronk7 ∙ Marnix H. Medema7 ∙ Ronnie de Jonge8,9 ∙ Corné MJ Pieterse8 ∙ Asaf Levy5 ∙ Klaus Schlaeppi10 ∙ Yang Bai2,3,12
La copertina di questo numero di Cella presenta l'articolo di ricerca di Dott. Yang Bai dell'Università di Pechino, intitolato "I genomi batterici e virali delle radici delle colture rivelano specie e modelli di microbioma inesplorati”.
Contesto della ricerca
I genomi di riferimento microbici della rizosfera sono essenziali per l'analisi metagenomica e gli studi sui meccanismi dei microbiomi della rizosfera delle colture. Attualmente, i genomi batterici della rizosfera delle colture disponibili al pubblico sono limitati in termini di quantità e diversità filogenetica, e la ricerca sulle interazioni batterio-virali negli ecosistemi della rizosfera delle colture è relativamente insufficiente.
Significato della ricerca
Espansione delle risorse genomiche: combinando la coltura batterica ad alto rendimento con il sequenziamento metagenomico, sono state costruite la collezione di genomi batterici della rizosfera di grano, riso, mais ed erba medica (CRBC) e la collezione di genomi virali (CRVC). La CRBC ha notevolmente ampliato il numero e la diversità filogenetica dei genomi batterici della rizosfera delle colture disponibili al pubblico, aumentando la diversità dei batteri della rizosfera delle colture del 290,6%; la CRVC contiene 9.736 genomi virali non ridondanti, inclusi 1.572 cluster a livello di genere mai segnalati prima nei microbiomi della rizosfera delle colture.
Scoperta funzionale e di interazione: da questi genomi sono state identificate funzioni batteriche conservate e arricchite nei microbiomi della rizosfera di diversi terreni e piante ospiti, e sono state rivelate interazioni batterico-virali precedentemente inesplorate negli ecosistemi della rizosfera delle colture.
Prospettive di ricerca
Ricerca sui meccanismi microbici: utilizzare CRBC e CRVC per esplorare in modo approfondito il meccanismo di interazione dei microrganismi della rizosfera delle colture, ad esempio il modo in cui le interazioni batteri-virus influenzano la struttura e la funzione delle comunità microbiche della rizosfera.
Esplorazione delle applicazioni agricole: sulla base di queste risorse genomiche, sviluppare strategie di regolamentazione per i microrganismi della rizosfera delle colture per promuovere la crescita e la salute delle colture e migliorare la sostenibilità della produzione agricola, ad esempio utilizzando specifici batteri o virus della rizosfera per migliorare la resistenza allo stress delle colture o la capacità di assorbimento dei nutrienti.
Processo di progettazione della copertina
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